这项研究首次追踪了这些病例的来源，并表明纽约市的SARS-CoV-2疫情主要是通过美国和欧洲之间未经追踪的传播引起的，而支持从中国或亚洲其他地方直接引入的证据并不充分。这些研究人员还记录了在此期间SARS-CoV-2在纽约市的早期社区传播。
美国纽约市SARS-CoV-2确诊病例，图片来自Science, 2020, doi:10.1126/science.abc1917。
纽约市已经成为美国SARS-CoV-2感染的主要疫情中心之一，在这个大都市地区有近17000人死亡。了解这种病毒何时来到纽约，以及它的传播路线，对于评估和设计遏制策略至关重要。
这些研究人员对在西奈山卫生系统的一家医院寻求护理的患者体内的SARS-CoV-2病毒进行了测序。对84个不同的SARS-CoV2基因组的系统发育分析表明纽约市的这种病毒主要由欧洲和美国其他地区的多个独立但孤立的来源引入。在居住在不同街区的患者身上发现的相关病毒集群表明，社区传播在3月18日之前就已经开始。
论文共同作者、西奈山伊坎医学院研究生Brianne Ciferri说，“我们的研究为这种新型病毒病原体的起源和多样性提供了意想不到的见解。我们发现了明确的证据，表明有来自世界和美国其他地方的多个不同病毒来源独立地引入纽约大都市地区。此外，我们在整个城市的不同街区发现了病毒毒株集群，这表明在3月18日之前，未被追踪的社区传播已经在进行。我们的研究结果凸显了在出现这种新型病原体的情况下，采取早期公共卫生应对措施的必要性。希望我们所发现的有关早期病毒传播和引入而成为全国疫情中心的证据，能够为今后在疫情早期应对阶段开展的公共卫生工作提供指导。”
