笔者从以下几个方面阐述我国医院药师与药店药师之间存在的巨大差距，从而指出提高药店药师素质的迫切性。
1、巨大的教育背景差异
首先，我国医院药师与药店药师存在巨大的教育背景差距。
从全国范围来看，所有乡镇以下基层公立医疗机构内药师的专业教育背景几乎均在大学专科以上，县级以上公立医疗机构中药师的专业教育背景普遍在大学本科学历以上，地市级以上的三级医院具有专业硕士、博士学历的药师占据很大比例，许多经济发达地区大医院药房内云集了众多世界顶尖高水平研究大学留学背景的博士后出站科研人员，并且在逐年不断增加。
一些医疗机构药学部门拥有一定数量具有临床医学、药学双重教育背景的研究生以上高层次人才。经过教育、卫生部门及各方面十余年的努力，我国的公立医疗机构药剂师的专业教育背景，已经接近甚至超过了发达国家的药师专业教育水平。
而与此同时，几十年来全国零售药店几乎所有药师的专业教育水平始终徘徊在中等职业教育的中专技校水平，且至今停滞不前。大量初中甚至小学毕业的社会人员混迹药店从业人员当中。因此，单凭专业教育背景来说，药店药师与医院药师之间就存在着无法平衡的巨大鸿沟。
药店药师要想在专业水准上达到或者超过医院药师，需要花大力气引进优秀人才、送出去培训，这将是一个系统性和长期性的工程。由于零售药店规模小、待遇微薄、社会地位低等因素，成为制约高水平药师向零售药店流动的关键因素。
2、专业水平和综合素质
其次，医院药师具有的专业技术水平和综合素质远远超越药店药师。
三级医疗机构患者众多，药师日常有机会接触到更多的药品和药物使用知识，同时大型医疗机构通常具有面向全员的高频率临床专业知识培训和技能实践。医院药师除了掌握比较扎实的药学专业知识技能外，且能够获得比较丰富的医学知识和技能。
在这方面药店药师无法比拟。医疗机构药师的学历准入门槛高，入职后更有贯穿整个职业生涯的专业技术职称考评体系监督。医院药师日常除了高强度的专业技术工作外，更要接受大量的专业知识培训和技能提高。医院药学部门每年都会选派人员前往国内一线城市的顶尖医院或者国外发达国家药学部门学习先进技术，从而不断提高专业技术水平。
此外，具备一定规模的医院药学部门每年都会对药师提出发表论文、开展科研课题、科普讲座宣传等综合性的工作和研究任务，促使医院药师能够在专业技术方面得到全方位的发展和提高。与医院药师相比，药店老板将药品推销数量和金额作为药店药师一切工作的出发点和最终目的，其它方面无暇顾及。天长日久，药店药师与医院药师的专业水平和综合素质差距越来越大。
3、人才结构差距甚远
再次，药店药师的零散队伍结构与医院药师系统性的人才结构差距甚远。
国家明文规定医院药学部门药学技术人员数量占据整个医疗技术人员总数的8%以上，通常三级医院药师数量达到数十人甚至数百人之多。药学部门通常由包括药学教授和研究生导师、主任及副主任药师、主管药师、药师等组成的系统性药学技术团队，专业技术水平高，综合技术实力强大、人才梯队结构合理。
而零售药店老板为了节约人力成本，根本不会高薪聘请高职称、高水准的专业药师，全国所有零售药店药师队伍几乎清一色由教育背景复杂的执业药师担任最高技术仲裁人员，这些执业药师大多并非药学和医学出身，受教育程度低，综合素质不高，一般也没有扎实系统的医学和药学工作经验。因此卫生系统拒绝承认专业背景复杂的执业药师。
而药店专业技术人员除了受教育程度不高、专业背景复杂的执业药师外，就是各地药监部门经过简单申报认定的“药师”。此外许多零售药店里混迹了大量社会闲杂人员以及40、50下岗职工阿姨充当药品推销人员。
可想而知，在这样的队伍结构中，其药学服务的专业性和层次肯定不会高了。
4、职业发展空间
最后，医院药师的职业发展空间要远远大于药店药师。许多大型医院药学部门具有完善的药学二级学科体系。药学部门除了设置传统的门诊和住院中西药房、药库外，普遍建立了静脉药物配置中心、中西药品制剂室、药检室、临床药学科以及治疗药物监测、基因检测、临床药物实验等众多系统性药学部门。
医院药师能够在药学各部门内进行不同岗位的专业技术训练和实践操作。而药店药师局限于工作环境硬件条件制约，无法接触和从事药学各学科岗位学习实践，只能从事单一的药品摆放、销售工作。对于药学学科发展的方向和进步无从得知。时间一长，药店药师的专业能力和思想眼界与医院药师的差距更加悬殊。
综上所述，现阶段我国各单体零售药店的药师素质与医院药师的综合素质相比，仍然具有较大差距。
这就要求零售药店监管部门重新评估和做好顶层设计，学习和借鉴国外发达国家先进药师管理经验，出台一系列鼓励和提高零售药店药师素质的政策和措施，并在全国范围内细化落实。从而为实现零售药店药师具备高水准的专业技术能力服务社会大众、获得社会认可不断努力。《药师法》的出台近在眼前，希望借助这部法律，逐步规范我国整体药师队伍逐渐系统化、均衡化。
